MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 43995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013416	ATG	2	6	246128	246133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866976
5002	NC_013416	ACA	2	6	246134	246139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866976
5003	NC_013416	CGA	2	6	246177	246182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866976
5004	NC_013416	CA	3	6	246183	246188	50 %	0 %	0 %	50 %	261866976
5005	NC_013416	CAAGCG	2	12	246271	246282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866976
5006	NC_013416	ATTA	2	8	246300	246307	50 %	50 %	0 %	0 %	261866976
5007	NC_013416	TCGGTT	2	12	246323	246334	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	261866976
5008	NC_013416	AAAT	2	8	246339	246346	75 %	25 %	0 %	0 %	261866976
5009	NC_013416	GC	3	6	246368	246373	0 %	0 %	50 %	50 %	261866976
5010	NC_013416	CGA	2	6	246381	246386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866976
5011	NC_013416	CGG	2	6	246443	246448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866976
5012	NC_013416	CGC	2	6	246562	246567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866976
5013	NC_013416	A	6	6	246574	246579	100 %	0 %	0 %	0 %	261866976
5014	NC_013416	GCCG	2	8	246582	246589	0 %	0 %	50 %	50 %	261866976
5015	NC_013416	TTG	2	6	246614	246619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866976
5016	NC_013416	CGG	2	6	246861	246866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866976
5017	NC_013416	GGC	2	6	246930	246935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866976
5018	NC_013416	CCA	2	6	247005	247010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866976
5019	NC_013416	GCG	2	6	247102	247107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866976
5020	NC_013416	GC	3	6	247198	247203	0 %	0 %	50 %	50 %	261866976
5021	NC_013416	AGC	2	6	247287	247292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866976
5022	NC_013416	A	6	6	247315	247320	100 %	0 %	0 %	0 %	261866976
5023	NC_013416	ATC	2	6	247474	247479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866976
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5025	NC_013416	CGT	2	6	247551	247556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866976
5026	NC_013416	TAA	2	6	247597	247602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013416	A	6	6	247601	247606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_013416	TCA	2	6	247612	247617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_013416	GGT	2	6	247620	247625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_013416	T	6	6	247625	247630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013416	TGA	2	6	247645	247650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013416	GAA	2	6	247758	247763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866977
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5037	NC_013416	TCG	2	6	248069	248074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_013416	CGG	2	6	248092	248097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_013416	GGT	2	6	248112	248117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_013416	ATC	2	6	248161	248166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866978
5041	NC_013416	AT	3	6	248189	248194	50 %	50 %	0 %	0 %	261866978
5042	NC_013416	CGG	2	6	248218	248223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866978
5043	NC_013416	T	6	6	248248	248253	0 %	100 %	0 %	0 %	261866978
5044	NC_013416	CAAT	2	8	248282	248289	50 %	25 %	0 %	25 %	261866978
5045	NC_013416	TTTGA	2	10	248356	248365	20 %	60 %	20 %	0 %	261866978
5046	NC_013416	T	7	7	248435	248441	0 %	100 %	0 %	0 %	261866978
5047	NC_013416	CGG	2	6	248531	248536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866978
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5051	NC_013416	CAA	2	6	248731	248736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866979
5052	NC_013416	TCA	2	6	248738	248743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866979
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5059	NC_013416	TGA	2	6	249138	249143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866979
5060	NC_013416	GGC	2	6	249271	249276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866979
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5062	NC_013416	T	6	6	249459	249464	0 %	100 %	0 %	0 %	261866979
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5069	NC_013416	ATT	2	6	249838	249843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_013416	TAT	2	6	249863	249868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866980
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5119	NC_013416	A	7	7	251780	251786	100 %	0 %	0 %	0 %	261866980
5120	NC_013416	GAAT	2	8	251798	251805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013416	ATT	2	6	251840	251845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013416	T	6	6	251852	251857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013416	CCG	2	6	252013	252018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866981
5124	NC_013416	TTC	2	6	252030	252035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866981
5125	NC_013416	CGG	2	6	252098	252103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866981
5126	NC_013416	TCC	2	6	252174	252179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866981
5127	NC_013416	GAT	2	6	252239	252244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866981
5128	NC_013416	ACC	2	6	252268	252273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866981
5129	NC_013416	ACC	2	6	252300	252305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866981
5130	NC_013416	TGT	2	6	252313	252318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866981
5131	NC_013416	CTC	2	6	252345	252350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866981
5132	NC_013416	GCG	2	6	252390	252395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866981
5133	NC_013416	CAA	2	6	252440	252445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866981
5134	NC_013416	TGG	2	6	252451	252456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866981
5135	NC_013416	A	7	7	252496	252502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_013416	T	6	6	252508	252513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_013416	GTG	2	6	252656	252661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866982
5138	NC_013416	CAA	2	6	252672	252677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
5139	NC_013416	AAC	2	6	252682	252687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
5140	NC_013416	CAA	2	6	252812	252817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
5141	NC_013416	AATTG	2	10	252823	252832	40 %	40 %	20 %	0 %	261866982
5142	NC_013416	TGCC	2	8	252878	252885	0 %	25 %	25 %	50 %	261866982
5143	NC_013416	T	6	6	252940	252945	0 %	100 %	0 %	0 %	261866982
5144	NC_013416	GTT	2	6	253016	253021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866982
5145	NC_013416	CCG	2	6	253036	253041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866982
5146	NC_013416	CGT	2	6	253049	253054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866982
5147	NC_013416	CGC	2	6	253153	253158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866982
5148	NC_013416	AAT	2	6	253245	253250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866982
5149	NC_013416	ATT	2	6	253253	253258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866982
5150	NC_013416	TGT	2	6	253310	253315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866982
5151	NC_013416	CAAGG	2	10	253578	253587	40 %	0 %	40 %	20 %	261866982
5152	NC_013416	GGC	2	6	253623	253628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866982
5153	NC_013416	GCA	2	6	253634	253639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866982
5154	NC_013416	GAAC	2	8	253640	253647	50 %	0 %	25 %	25 %	261866982
5155	NC_013416	CGG	2	6	253724	253729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866982
5156	NC_013416	CGATC	2	10	253739	253748	20 %	20 %	20 %	40 %	261866982
5157	NC_013416	GGAC	2	8	253922	253929	25 %	0 %	50 %	25 %	261866982
5158	NC_013416	AAC	2	6	253981	253986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
5159	NC_013416	TGCG	2	8	254008	254015	0 %	25 %	50 %	25 %	261866982
5160	NC_013416	ATTGA	2	10	254115	254124	40 %	40 %	20 %	0 %	261866982
5161	NC_013416	TA	3	6	254152	254157	50 %	50 %	0 %	0 %	261866982
5162	NC_013416	CGG	2	6	254279	254284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866982
5163	NC_013416	ATCA	2	8	254331	254338	50 %	25 %	0 %	25 %	261866982
5164	NC_013416	CAA	2	6	254475	254480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
5165	NC_013416	CCA	2	6	254495	254500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866982
5166	NC_013416	TTA	2	6	254530	254535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866982
5167	NC_013416	TGAAC	2	10	254561	254570	40 %	20 %	20 %	20 %	261866982
5168	NC_013416	GGT	2	6	254577	254582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866982
5169	NC_013416	CAA	2	6	254669	254674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
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5171	NC_013416	TGA	2	6	254719	254724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866982
5172	NC_013416	CAA	2	6	254847	254852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866982
5173	NC_013416	A	6	6	254851	254856	100 %	0 %	0 %	0 %	261866982
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5181	NC_013416	A	6	6	255341	255346	100 %	0 %	0 %	0 %	261866983
5182	NC_013416	T	7	7	255356	255362	0 %	100 %	0 %	0 %	261866983
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5185	NC_013416	AAG	2	6	255426	255431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866983
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5187	NC_013416	CGG	2	6	255543	255548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866983
5188	NC_013416	TAA	2	6	255583	255588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5189	NC_013416	TTA	2	6	255647	255652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5190	NC_013416	GA	3	6	255687	255692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5191	NC_013416	GATAT	2	10	255717	255726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5192	NC_013416	TAAA	2	8	255866	255873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5193	NC_013416	A	7	7	255878	255884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5194	NC_013416	ACG	2	6	255894	255899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5195	NC_013416	AGC	2	6	255913	255918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5196	NC_013416	TAA	2	6	255920	255925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5197	NC_013416	ATTAA	2	10	256030	256039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5198	NC_013416	GTCC	2	8	256064	256071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5199	NC_013416	C	6	6	256149	256154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5200	NC_013416	CCA	2	6	256159	256164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5201	NC_013416	T	6	6	256228	256233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5202	NC_013416	TAC	2	6	256257	256262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5203	NC_013416	CGC	2	6	256317	256322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866984
5204	NC_013416	GA	3	6	256357	256362	50 %	0 %	50 %	0 %	261866984
5205	NC_013416	AAC	2	6	256367	256372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866984
5206	NC_013416	TAG	2	6	256476	256481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5207	NC_013416	CAAT	2	8	256542	256549	50 %	25 %	0 %	25 %	261866985
5208	NC_013416	TTTG	2	8	256598	256605	0 %	75 %	25 %	0 %	261866985
5209	NC_013416	T	6	6	256619	256624	0 %	100 %	0 %	0 %	261866985
5210	NC_013416	A	7	7	256629	256635	100 %	0 %	0 %	0 %	261866985
5211	NC_013416	TAA	2	6	256675	256680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_013416	ATT	2	6	256704	256709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866986
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5216	NC_013416	A	6	6	256987	256992	100 %	0 %	0 %	0 %	261866986
5217	NC_013416	A	6	6	257027	257032	100 %	0 %	0 %	0 %	261866986
5218	NC_013416	T	6	6	257167	257172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5219	NC_013416	TGA	2	6	257339	257344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_013416	GTAAGA	2	12	257413	257424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_013416	T	8	8	257455	257462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_013416	GGTAG	2	10	257463	257472	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_013416	TTTC	2	8	257479	257486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5224	NC_013416	A	6	6	257528	257533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_013416	ATTT	2	8	257567	257574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_013416	TTAA	2	8	257589	257596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5227	NC_013416	TTG	2	6	257597	257602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_013416	TG	3	6	257698	257703	0 %	50 %	50 %	0 %	261866987
5229	NC_013416	CAT	2	6	257718	257723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866987
5230	NC_013416	CAAAA	2	10	257764	257773	80 %	0 %	0 %	20 %	261866987
5231	NC_013416	GTA	2	6	257805	257810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866987
5232	NC_013416	AAG	2	6	257860	257865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866987
5233	NC_013416	GCC	2	6	257871	257876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866987
5234	NC_013416	GCC	2	6	257967	257972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866987
5235	NC_013416	A	6	6	258021	258026	100 %	0 %	0 %	0 %	261866987
5236	NC_013416	GGC	2	6	258102	258107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866987
5237	NC_013416	AAAC	2	8	258135	258142	75 %	0 %	0 %	25 %	261866987
5238	NC_013416	CGG	2	6	258170	258175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866987
5239	NC_013416	ATT	2	6	258252	258257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866987
5240	NC_013416	TTA	2	6	258284	258289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866987
5241	NC_013416	ACAGC	2	10	258308	258317	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5242	NC_013416	A	6	6	258324	258329	100 %	0 %	0 %	0 %	261866988
5243	NC_013416	CAAA	2	8	258365	258372	75 %	0 %	0 %	25 %	261866988
5244	NC_013416	GGC	2	6	258474	258479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866988
5245	NC_013416	TGA	2	6	258487	258492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866988
5246	NC_013416	A	6	6	258499	258504	100 %	0 %	0 %	0 %	261866988
5247	NC_013416	CAA	2	6	258531	258536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866988
5248	NC_013416	A	6	6	258553	258558	100 %	0 %	0 %	0 %	261866988
5249	NC_013416	CGC	2	6	258575	258580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866988
5250	NC_013416	TTC	2	6	258609	258614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866988
5251	NC_013416	TTG	2	6	258680	258685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866988
5252	NC_013416	GCG	2	6	258742	258747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866988
5253	NC_013416	ATT	2	6	258751	258756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866988
5254	NC_013416	CAC	2	6	258815	258820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866988
5255	NC_013416	A	7	7	258854	258860	100 %	0 %	0 %	0 %	261866988
5256	NC_013416	CAA	2	6	258966	258971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866988
5257	NC_013416	CTG	2	6	259002	259007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866988
5258	NC_013416	CCAA	2	8	259012	259019	50 %	0 %	0 %	50 %	261866988
5259	NC_013416	CGG	2	6	259027	259032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866988
5260	NC_013416	ATC	2	6	259093	259098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_013416	T	6	6	259105	259110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_013416	CA	3	6	259111	259116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5263	NC_013416	TGCAAT	2	12	259156	259167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5264	NC_013416	GGT	2	6	259336	259341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866989
5265	NC_013416	GAT	2	6	259343	259348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866989
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5267	NC_013416	GCA	2	6	259502	259507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866989
5268	NC_013416	TGA	2	6	259579	259584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866989
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5270	NC_013416	AGC	2	6	259687	259692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866989
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5272	NC_013416	CGC	2	6	259726	259731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866989
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5276	NC_013416	CAAA	2	8	259870	259877	75 %	0 %	0 %	25 %	261866989
5277	NC_013416	ATT	2	6	259892	259897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866989
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5280	NC_013416	CCTC	2	8	260070	260077	0 %	25 %	0 %	75 %	261866989
5281	NC_013416	GCG	2	6	260098	260103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866989
5282	NC_013416	GTT	2	6	260113	260118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866989
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5284	NC_013416	GGC	2	6	260170	260175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866989
5285	NC_013416	AGTG	2	8	260206	260213	25 %	25 %	50 %	0 %	261866989
5286	NC_013416	A	11	11	260390	260400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5287	NC_013416	ATT	2	6	260448	260453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866990
5288	NC_013416	T	6	6	260452	260457	0 %	100 %	0 %	0 %	261866990
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5291	NC_013416	TCG	2	6	260516	260521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866990
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5320	NC_013416	GTT	2	6	261684	261689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866990
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5322	NC_013416	CGG	2	6	261780	261785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866990
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5325	NC_013416	GC	3	6	261850	261855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5326	NC_013416	AGTTA	2	10	261880	261889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5327	NC_013416	CGC	2	6	261896	261901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5328	NC_013416	CAT	2	6	261928	261933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866991
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5332	NC_013416	CGC	2	6	262212	262217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866991
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5367	NC_013416	CAC	2	6	263676	263681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866992
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5371	NC_013416	CCA	2	6	263801	263806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866992
5372	NC_013416	AC	3	6	263823	263828	50 %	0 %	0 %	50 %	261866992
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